'Los hombres de Paco' despide su primera temporada en Antena 3 con el episodio titulado 'Bajo Tierra'. Lucas intentará, a la desesperada, salvar a Sara de ser asesinada. Povedilla, por su parte, olerá la muerte de cerca por uno de esos famosos malentendidos que sitúan a la comisaría al borde del abismo y a él, en un ataúd a punto de ser incinerado.

El episodio que cierra la primera temporada resuelve el caso de corrupción policial. Al mismo tiempo, se dejan en suspenso otras tramas como la relación sentimental que Lucas y Sara están viviendo a espaldas de Paco, el padre de la joven. Por otra parte, Rita descubre que está embarazada cuando todos creen que el padre, Povedilla, ha sido incinerado por equivocación.

Lucas es apartado de sus funciones por Torres, el comisario corrupto que quiere matar a Sara, la única persona que presenció el asesinato cometido por él. Torres utiliza el arma que le entrega el policía para matar a Blasco, su hombre de confianza y único detenido hasta el momento. De esta forma conseguirá que Lucas sea arrestado, acusado de asesinato. Sin embargo, Silvia y Montoya, que confían en su inocencia, le ayudarán a escapar del calabozo. El policía inicia entonces una carrera desesperada para salvar a Sara, refugiada en un pueblo de la sierra.

Consciente de que está en riesgo la vida de su nieta, Don Lorenzo hace que ella y Lola se refugien en un pueblo a las afueras de la ciudad. Paco, que no sabe lo que está pasando, se muestra cada vez más trastornado y acaba apuntando a Lucas, su mejor amigo, con una pistola, convencido de que tiene la culpa de todo lo malo que le pasa a Sara. Mariano se interpone entre ellos y Lucas, desesperado, busca la forma de encontrar a Sara antes de que sea localizada por los asesinos.

El padre de Paco muere en un desgraciado accidente nada más llegar de visita. Durante el velatorio descubren que el padre del inspector comparte ataúd con el cuerpo sin vida de un inmigrante chino. A raíz de ello, se pone en marcha una operación policial en la que Povedilla se hace pasar por muerto para conseguir detener a la mafia china que está detrás de este suceso. En la funeraria, los agentes no se percatan del intercambio que se ha producido entre los féretros y Povedilla es enviado al crematorio. Mientras, Rita comunica su embarazo a sus compañeros.